Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a6B1AVK5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms