Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms