Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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