Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms