Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms