Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms