Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms