Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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