Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms