Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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