Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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