Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms