Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ilf3Q9Z1X4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms