Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp21Q9QZL6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms