Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms