Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ercc4Q9QZD4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ercc4Q9QZD4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ercc4Q9QZD4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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