Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tnnt3Q9QZ47 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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