Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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