Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fscn3Q9QXW4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fscn3Q9QXW4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fscn3Q9QXW4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms