Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Limd1Q9QXD8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Limd1Q9QXD8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Limd1Q9QXD8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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