Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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