Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms