Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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SrfQ9JM73 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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SrfQ9JM73 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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SrfQ9JM73 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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SrfQ9JM73 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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SrfQ9JM73 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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