Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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