Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms