Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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