Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms