Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms