Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms