Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms