Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms