Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms