Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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