Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms