Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt112Q9DCG9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms