Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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