Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms