Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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