Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem239Q9DA47 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem239Q9DA47 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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