Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms