Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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