Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Alkbh4Q9D8F1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms