Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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