Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ccdc130Q9D516 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc130Q9D516 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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