Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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