Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms