Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms