Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms