Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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