Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms